Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT10P13645 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT10P13645 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT10P13645 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT10P13645 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT10P13645 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT10P13645 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT10P13645 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT10P13645 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT10P13645 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT10P13645 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT10P13645 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT10P13645 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT10P13645 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT10P13645 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT10P13645 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT10P13645 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT10P13645 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT10P13645 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT10P13645 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT10P13645 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms