Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ACTN1P12814 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms