Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TPRP12270 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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TPRP12270 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TPRP12270 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TPRP12270 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TPRP12270 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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