Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEFHP12036 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEFHP12036 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEFHP12036 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEFHP12036 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEFHP12036 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms