Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCF2P10911 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCF2P10911 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCF2P10911 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCF2P10911 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCF2P10911 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCF2P10911 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCF2P10911 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCF2P10911 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCF2P10911 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCF2P10911 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCF2P10911 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCF2P10911 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms