Protein–RNA interactions for Protein: P0CK96

SLC35E2B, Solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2BP0CK96 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35E2BP0CK96 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms