Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX6O95503 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX6O95503 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX6O95503 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX6O95503 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX6O95503 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX6O95503 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms