Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SEC24DO94855 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SEC24DO94855 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SEC24DO94855 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SEC24DO94855 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SEC24DO94855 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SEC24DO94855 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SEC24DO94855 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SEC24DO94855 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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