Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KDELR3O43731 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR3O43731 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms