Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms