Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SRRM4A7MD48 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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