Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP4B1Q9Y6B7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms