Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP16Q9Y5T5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
USP16Q9Y5T5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP16Q9Y5T5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms