Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL3Q9Y4R7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTLL3Q9Y4R7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL3Q9Y4R7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms