Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
WASHC2CQ9Y4E1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
WASHC2CQ9Y4E1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
WASHC2CQ9Y4E1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
WASHC2CQ9Y4E1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
WASHC2CQ9Y4E1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
WASHC2CQ9Y4E1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
WASHC2CQ9Y4E1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
WASHC2CQ9Y4E1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
WASHC2CQ9Y4E1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms