Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q9Y3F1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q9Y3F1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q9Y3F1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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