Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNIP3Q9Y2W7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms