Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2Q9Y2U9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHDC2Q9Y2U9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms