Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
AP3M1Q9Y2T2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3M1Q9Y2T2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M1Q9Y2T2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms