Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A8Q9Y2E8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A8Q9Y2E8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms