Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKAP1Q9Y2A7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCKAP1Q9Y2A7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1Q9Y2A7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCKAP1Q9Y2A7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCKAP1Q9Y2A7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms