Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC4Q9Y296 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC4Q9Y296 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.3 ms