Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3LQ9Y262 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3LQ9Y262 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3LQ9Y262 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3LQ9Y262 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3LQ9Y262 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3LQ9Y262 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms