Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HPS5Q9UPZ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS5Q9UPZ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms