Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A2Q9UPR5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A2Q9UPR5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms