Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PHF8Q9UPP1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PHF8Q9UPP1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PHF8Q9UPP1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms