Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP4E1Q9UPM8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP4E1Q9UPM8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AP4E1Q9UPM8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP4E1Q9UPM8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
AP4E1Q9UPM8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms