Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF2Q9UNY4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTF2Q9UNY4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms