Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNRGQ9UMZ2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNRGQ9UMZ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNRGQ9UMZ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms