Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP17Q9ULZ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP17Q9ULZ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms