Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND2AQ9ULE3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND2AQ9ULE3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND2AQ9ULE3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms