Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH7Q9ULB5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH7Q9ULB5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH7Q9ULB5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms