Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NRXN1Q9ULB1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN1Q9ULB1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NRXN1Q9ULB1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NRXN1Q9ULB1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms