Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SARDHQ9UL12 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SARDHQ9UL12 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms