Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC9Q9UKV0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC9Q9UKV0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms