Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PILRAQ9UKJ1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PILRAQ9UKJ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PILRAQ9UKJ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PILRAQ9UKJ1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PILRAQ9UKJ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms