Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
STAG3Q9UJ98 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
STAG3Q9UJ98 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.82■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.81■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.8■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.78■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.77■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
STAG3Q9UJ98 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms