Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MBD1Q9UIS9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD1Q9UIS9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD1Q9UIS9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms