Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEFF2Q9UIK5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEFF2Q9UIK5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms