Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASIC3Q9UHC3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ASIC3Q9UHC3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms