Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBF1Q9UH73 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EBF1Q9UH73 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms