Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA6Q9UF33 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHA6Q9UF33 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHA6Q9UF33 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms