Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIP2Q9UDT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIP2Q9UDT6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIP2Q9UDT6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms