Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APEX2Q9UBZ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms