Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXF1Q9UBU9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXF1Q9UBU9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms