Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD2Q9UBJ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD2Q9UBJ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms