Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNMT3BQ9UBC3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNMT3BQ9UBC3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNMT3BQ9UBC3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms