Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL42Q9P2K6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms