Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALCOCO1Q9P1Z2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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