Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PHRF1Q9P1Y6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PHRF1Q9P1Y6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms